Née en 1978, Isabelle Sauveur commence ses études de clavecin au Conservatoire du Mans. Après un passage dans la classe de Françoise Marmin au CNR d'Angers, où elle obtient un 1er prix à l'unanimité et avec les félicitations du jury en 1996, elle poursuit sa formation au Conservatoire Nationale Supérieur de Musique de Paris dans la classe de Christophe Rousset. En 2000, on lui décerne le Diplôme de Formation Supérieure avec mention très bien. Elle travaille également pendant cette période avec Blandine Rannou, et Kenneth Weiss pour la basse continue, avec Emmanuelle Haïm pour l'accompagnement des chanteurs et avec Pierre Hantaï. Elle se perfectionne ensuite dans la classe de basse continue d'Yves Rechsteiner au CNSM de Lyon où elle obtient le Diplôme d'Etudes générales mention très bien en 2002, tout en suivant les classes de Pédagogie au CNSM de Paris.